قسم وظائف الاعضاء هو احد الاقسام الرئيسية في العلوم الاساسية الذي تم افتتاحة في عام 1990 ويقع علي عاتقه تدريس وظائف الاعضاء في مقررات الاجهزة لطلاب الطب والدراسات العليا , يتبع للقسم معمل وظائف الأعضاء والذي تم انشاءه في عام 1992 بمعمل العلوم الاساسية وتم شراء جميع الاجهزة مع مراعاة التكنولوجيا الحديثة فى استجلاب الأجهزة , هذا المعمل منح بواسطة مجلس العمداء لكليات (الصيدلة – الاسنان – الطبية التطبيقية بالاضافة لكلية الطب) لتقوم هذه الكليات بتدريس العملى بها. كما تم تعيين فنيين للمعمل تم تدريبهم علي العمل بمعمل وظائف الاعضاء الذي تجري فيه كل التجارب العملية للطلاب .
في العام 1994 أجيز برنامج ماجستير و دكتوراه وظائف الأعضاء باتفاقية شراكة مع جامعة مانشستر ببريطانيا. كما تمت الأجازة والتسجيل لماجستير الكيمياء الحيوية والتغذية وشهد نفس العام بداية برامج الدكتوراه السريرية في التخصصات المختلفة.