بدأ قسم الباطنية مع بداية كلية الطب في السبعينات ويتميز القسم بتنوع البحوث السريرية, ويقوم القسم بالبحث لايجاد طريقة علمية أكاديمية فعالة في تقويم طلبة الطب سريرياً في المستشفيات.
الاهتمامات البحثية في القسم:
الأمراض الروماتيزمية
أمراض الجهاز الهضمي
الحميات والأمراض الوبائية
مرض نقص المناعة المكتسب الإيدز و غير ذلك من التخصصات.